应缴国库款是指事业单位按规定取得的应上缴国家预算的各种款项，包括以下内容：1、事业单位代收的纳入预算管理的基金;2、行政性收费收入;3、罚没收入;4、无主财物变价收入;5、其他按预算管理规定应上缴预算的款项，如固定资产处置净收益等。
应缴财政专户款是事业单位按规定代收的应上缴财政专户的预算外资金。其中预算外资金，是指国家机关、事业单位和社会团体为履行和代行政府职能，依据国家法律、法规和具有法律效力的规章而收取、提取和安排使用的未纳入国家预算管理的各种财政性资金。
根据《财政部关于将按预算外资金管理的收入纳入预算管理的通知》(财预〔2010〕88号)有关要求，从2011年起，除教育收费纳入财政专户管理外，其他预算外资金全部纳入预算管理。此举意味着从2011年开始，预算外资金成为了历史，财政管理进入了全面综合预算管理的新阶段。
应缴国库款和应缴财政专户款账务处理怎么做?
应缴财政专户款：
一、本科目核算事业单位按规定应缴入财政专户的款项。
二、本科目应当按照应缴财政专户的各款项类别进行明细核算。
三、应缴财政专户款的主要账务处理如下：
(一)取得应缴财政专户的款项时，借记有关科目，贷记本科目。
(二)上缴款项时，借记本科目，贷记“银行存款”等科目。
四、本科目期末贷方余额，反映事业单位应缴入财政专户但尚未缴纳的款项。
应缴国库款：
一、本科目核算事业单位按规定应缴入国库的款项(应缴税费除外)。
二、本科目应当按照应缴国库的各款项类别进行明细核算。
三、应缴国库款的主要账务处理如下：
(一)按规定计算确定或实际取得应缴国库的款项时，借记有关科目，贷记本科目。
(二)事业单位处臵资产取得的应上缴国库的处臵净收入的账务处理，参见“待处臵资产损溢”科目。
(三)上缴款项时，借记本科目，贷记“银行存款”等科目。
四、本科目期末贷方余额，反映事业单位应缴入国库但尚未缴纳的款项。
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