答：按照政策规定，现在的开票限额不是按年计算，而是连续经营的12个月，因此，一旦你在6月份超出的话，应该再6月份左右就要申请一般纳税人。在办理一般纳税人前，超出的部分还是按3%纳税。一旦税务机关要求你办理一般纳税人，而你超过规定期限未办理，则以后的销售要按17%征税。
举个例子，小规模纳税人开具普通增值税发票超过限额9万了，按超过的部分按征收率计算增值税，申报表填写全部收入，和全部应纳税额，在进行交款时会自动扣除9万以内的税额。
小规模纳税人开票的会计分录
比如，小规模适用3%征收率，开票1000是含税价，做分录
借：应收账款 1000
贷：主营业务收入 1000/(1+3%)=970.87
应交税费——应交增值税 1000/(1+3%)*3%=29.13
月底不需要结转税金，下月初申报增值税 的时候，直接
借：应交税费——应交增值税
贷：银行存款
